Un par de adolescentes investigan el asesinato de un compañero de clase mientras se enamoran por primera vez.

Después de enfrentarse a Shredder, que ha unido fuerzas con el científico loco Baxter Stockman y sus secuaces Bebop y Rocksteady para conquistar el mundo, las Tortugas deben enfrentarse a un enemigo aún mayor: el famoso Krang.