Capitán, Kowalski, Rico y Soldado unen fuerzas con la organización encubierta Viento Norte para evitar que el villano Dr. Octavius Salitre destruya el mundo tal y como lo conocemos.

Los animales de Madagascar se unen a un circo europeo en apuros para regresar a Nueva York, pero se ven perseguidos por un oficial psicótico de control de animales.

Cuando su nuevo suegro, el rey Harold enferma, Shrek es visto como el heredero de la tierra de Muy, Muy Lejano. Shrek, recluta a sus amigos Burro y el Gato con Botas para instalar a la rebelde Artie como el nuevo rey. La princesa Fiona, sin embargo, reúne a una banda de novias para defenderse de un golpe de estado por parte del Príncipe Azul.

De vuelta en Muy Muy Lejano, Shrek y Fiona anuncian su unión, pero el siniestro plan del príncipe Encantador atenta contra la sempiterna felicidad conyugal.

En una misión para recuperar a una hermosa princesa de las garras de un dragón feroz, un ogro gruñón forma un equipo con un burro ocurrente.